Російські біологи запропонували боротися з чорною ніжкою за допомогою вірусів-бактеріофагів, що знищують специфічні види бактерій, але не шкодять картоплі та людині. Результати цього дослідження опубліковано в журналі Віруси.
Фагові коктейлі (суміші різних бактеріофагів) використовуються у сільському господарстві проти хвороб рослин. З їх допомогою можна скоротити втрати через псування продукції. Але поки що спроби захистити картоплю від м'якої гнилі не йдуть далі лабораторної пробірки та модельних штамів, а такі умови відрізняються від реальних. Щоб вирішити ці проблеми, потрібно чітко визначити список патогенних бактерій, шкідливих для картоплі. Потім відібрати фаги, які найкраще з ними справляються, виділити їх у чистій культурі, розробити та запустити технологію їх застосування в умовах сховищ. Вчені з Російського університету дружби народів провели дослідження з цієї теми.
«Щоб застосовувати фаговий коктейль проти м'якої гнилі у промислових масштабах, потрібно відповісти на безліч питань щодо геноміки бактерій. Пектобактерії та вірусів, що спеціалізуються на них, краще зрозуміти молекулярно-біологічні основи їхньої взаємодії. Також потрібно розібратися з технічними деталями — виробництвом коктейлю та формою його застосування та отримати дозволи на законодавчому рівні. Наше дослідження допоможе вирішити ці проблеми», - розповів професор агробіотехнологічного департаменту РУДН, доктор біологічних наук Олександр Ігнатов.
Вчені з РУДН разом із колегами з Дослідницького центру «ФітоІнженерія», Інституту біоорганічної хімії РАН, а також МДУ зібрали зразки картоплі з промислових сховищ для визначення основних патогенних бактерій.
Штами розрізняли за допомогою ПЛР-тесту та за варіаціями у послідовності гена 16S рРНК. Вчені з'ясували, що штами, які на вигляд ставилися до Pectobacterium carotovorum, насправді належали до нещодавно певного виду Pectobacterium versatile. Крім нього, найпоширенішими виявилися штами Pectobacterium brasilense и Pectobacterium polaris, що часто зустрічаються на полях Центральної та Східної Європи. А от Pectobacterium atrosepticum та представників роду Дікея, які викликали спалахи захворювань на початку двохтисячних років, у зразках не виявилося. Мікробіологи протестували на цих штамах 50 бактеріофагів та відібрали найефективніші. При цьому вчені за геномними послідовностями визначили віруси, які знищуватимуть бактерії, а не просто заражатимуть їх, вбудовуватимуться в їхній геном і переходитимуть у «сплячий режим». Коктейль перевірили у промисловому сховищі картоплі в агропарку «Рогачове». Бульби обробляли раз на тиждень протягом шести місяців. У результаті зростання фітопатогенних бактерій на бульбах знизився у 10-12 разів.